基本的に、南部連合軍が運用すべき部隊は敵の前線を破るための侵攻用と敵の侵攻軍を撃退するための防衛軍の二つがあれば十分です。しかし、その任務に応じて編成を入れ替える必要が色々とありますので、予備として違う編成をした部隊を用意しておき、必要になる都度入れ替えることとなるでしょう。
具体的な人数としては、正規2部隊32名+予備1部隊16名が居れば十分です。
実に多数の兵士が参入する南部連合軍ですが、実は50名足らずの小人数でもクリアには支障無いのです。もちろん質は厳しく問われるのですが……。